烟草Hsp70基因家族的鉴定及叶肉内CpH-sp70基因的表达分析

• 作者: 孙占伟 宋朝鹏 张明刚 李成刚 杨晓亮 申洪涛 陈二龙
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 热激蛋白70 基因家族 生物信息学 叶绿体
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 页码范围: 553-562
• 页数: 10页
• 分类号: S572|Q786
• 字数: 5011字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13327/j.jjlau.2019.3967

摘要

以NCBI和SGN数据库为基础,使用生物信息学技术对烟草Hsp70基因家族的成员进行鉴定,且以烟草品种"红花大金元"为材料,运用实时荧光定量PCR法,分析在烟草叶肉内发挥作用的CpHsp70基因成员在高温的逆境环境的表达量.结果表明:烟草含有61个Hsp70基因成员,其理化特性存在差异;染色体定位显示,Hsp70基因分布在18条染色体中,其中叶绿体成员分布在6、17、19号染色体;系统进化显示,烟草Hsp70基因分布在5组,2亚组,叶绿体成员位于Ⅴ-A亚组;基因结构显示,内含子数为0～13,叶绿体成员内含子数为7;保守基序显示,Motif在各组之间具有差异,特异性的Motif 16、Motif 17、Motif 20位于Ⅰ组的细胞质成员中,Motif 2、Motif 5属于Ⅲ组细胞质和Ⅳ组内质网成员中,Motif 15和Motif 19存在Ⅴ-A亚组叶绿体成员中;实时荧光定量PCR分析呈现,NtCpHsp70基因不易受高温诱导.综上,烟草Hsp70功能结构具有多样性,而NtCpHsp70基因表达受烘烤环境的影响较小.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋朝鹏	河南农业大学烟草学院	141	2535	26.0	43.0
2	申洪涛		25	22	3.0	4.0
3	陈二龙	河南农业大学烟草学院	6	62	4.0	6.0
5	李成刚		11	17	3.0	3.0
6	孙占伟		7	3	1.0	1.0
7	张明刚		4	1	1.0	1.0
10	杨晓亮		9	3	1.0	1.0