利用荧光SSR分析中国糜子的遗传多样性和群体遗传结构

• 作者: 付国庆 刘敏轩 寇淑君 左振兴 王瑶 纪军建 陆平 霍阿红
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 糜子 SSR荧光标记 遗传多样性 群体结构
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1475-1487
• 页数: 13页
• 字数: 10187字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2019.09.001

摘要

[目的]利用荧光SSR研究中国糜子的遗传多样性与群体遗传结构,为糜子品种改良、种质创新和资源利用提供依据.[方法]用不同地理来源且表型差异较大的6份糜子材料对SSR引物进行筛选,通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳获得条带清晰、稳定性好、多态性高的糜子SSR引物,对筛选出的引物5'末端进行6-FAM、HEX、ROX和TAMRA荧光标记,利用基因分析仪检测不同等位变异的扩增片段大小,并以此来分析1 31份糜子材料的遗传多样性和群体结构.[结果]从202对SSR引物中共筛选出22对扩增稳定、多态性好的SSR引物,能同时适用于传统变性PAGE胶电泳和荧光SSR标记-全自动分析检测技术.22对SSR引物共检测出128个主要等位变异,平均每个位点5.82个;基因多样性指数变化范围为0.3572-0.8132,平均0.6284;多态性信息含量为0.2934-0.8150,平均0.5874;Shannon多样性指数为0.5427-1.7681,平均1.2062.不同生态区糜子种质间遗传距离的变化范围为0.0764-0.7251,平均0.3121,遗传一致度的变化范围为0.4843-0.9265,平均0.7465.其中,北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的遗传距离最小,遗传一致度最高,亲缘关系较近.UPGMA聚类分析显示,北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的材料聚为一类,个体间聚类,东北春糜子区的育成品种和农家种聚类结果一致,黄土高原春夏糜子区的育成品种在多个组群中都有出现.通过绘制K与△K的关系图,K=4时,△K最大,据此将1 31份糜子材料划分为4个类群,类群Ⅰ代表北方春糜子区;类群Ⅱ主要来自东北春糜子区;类群ⅢⅡ主要是北方春糜子区,群组Ⅳ主要是黄土高原春夏糜子区.各群体中大部分品种亲缘关系单一,少数品种含有其他组群的遗传成分.基于遗传距离的聚类分析与群体遗传结构分析结果基本一致,表明糜子的遗传差异与地理来源相关.[结论]北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的遗传多样性比较丰富,东北春糜子区的育成品种主要以农家种为遗传背景选育而来,黄土高原春夏糜子区在育种过程中引种资源广泛,与其他生态区存在基因交流.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	霍阿红		11	45	4.0	6.0
2	陆平	中国农业科学院作物科学研究所	22	251	8.0	15.0
3	刘敏轩	中国农业科学院作物科学研究所	15	168	8.0	12.0
4	寇淑君		2	2	1.0	1.0
5	付国庆		1	2	1.0	1.0
6	纪军建		1	2	1.0	1.0
7	王瑶		1	2	1.0	1.0
8	左振兴		1	2	1.0	1.0