黄姑鱼耐寒相关基因CIRP、nefm的克隆及表达特征分析

• 作者: 宋红彬 徐冬冬 楼宝 游翘楚 田璐 迟长凤
• 来源期刊: 浙江海洋学院学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 黄姑鱼 冷胁迫 CIRP nefm qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 页码范围: 286-294,308
• 页数: 10页
• 分类号: Q781
• 字数: 6409字
• 语种: 中文

摘要

为了研究黄姑鱼耐低温相关的基因,对耐寒候选基因冷诱导RNA结合蛋白CIRP(cold-inducible RNA-bindingprotein)和神经微丝蛋白nefm(neurofilament medium polypeptide)进行了克隆并分析其在低温下的表达模式.通过同源克隆和5'/3'Race的方法扩增得到耐寒候选基因CIRP和nefm基因的cDNA核心序列.CIRP基因cDNA核心序列为3 460 bp,其开放阅读框为543 bp,编码180个氨基酸;nefm基因cDNA核心序列为1 116 bp,其开放阅读框为1 107 bp,编码369个氨基酸.采用N-J bootstrap方法构建的系统进化树同源性分析表明黄姑鱼的CIRP和nefm氨基酸序列分别与银鳕和大黄鱼的相似度最高.利用qRT-PCR分析2个基因在脑、鳃、肝和肾等4个组织中随低温胁迫的相对表达量变化,结果显示CIRP和nefm基因在上述4个组织中都发生显著变化,表明这2个基因可能都参与了黄姑鱼抵抗低温胁迫的过程,可以作为抗寒或选育等相关研究的候选基因.