浅色黄姑鱼线粒体16S rRNA基因片段序列特征分析

• 作者: 喻达辉 李莉好 杜博 童馨 郭奕惠 黄桂菊 龚世园
• 来源期刊: 海洋水产研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 浅色黄姑鱼 线粒体16srRNA基因 序列分析 RFLP
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 85-91
• 页数: 7页
• 分类号: Q244
• 字数: 3379字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2007.03.013

摘要

PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16S rRNA基因片段序列,得到大约620 bp的扩增产物.将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468 bp可供比对分析的片段.比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变.PCR-RFLP分析结果显示,两个种群的100个样品中98 %的个体为其中一种单倍型,只有2 %的个体呈另一种单倍型,表明这两个种群的遗传多样性较低.两个单倍型平均碱基组成为:T 22.0 %,C 26.3 %,A 29.8 %,G 21.9 %,GC含量平均为48.2 %.与GenBank中石首鱼科7属9种的11条同源序列比对,得到429个比对位点,其中包括69个简约信息位点、55个单突变子和16个插入/缺失位点.聚类分析显示,浅色黄姑鱼与黄姑鱼亲缘关系较近,与形态分类相符.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	喻达辉	中国水产科学研究院南海水产研究所	55	800	18.0	26.0
2	李莉好		8	120	6.0	8.0
3	郭奕惠	中国水产科学研究院南海水产研究所	21	262	9.0	16.0
4	黄桂菊	中国水产科学研究院南海水产研究所	25	411	13.0	20.0
5	龚世园	华中农业大学水产学院	81	1142	22.0	29.0
6	杜博	华中农业大学水产学院	4	60	4.0	4.0
10	童馨	华中农业大学水产学院	4	60	4.0	4.0