基于基因组突变数据分析肝癌预后分子标志物

• 作者: 刘文斌 曹广文 茅新如
• 来源期刊: 中国癌症防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝细胞癌 肿瘤突变负荷 预后 细胞周期调控通路
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 143-150
• 页数: 8页
• 分类号: R735.7
• 字数: 3805字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5671.2019.02.11

摘要

目的 探讨肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)及关键信号通路的基因变异与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的相关性.方法 从TCGA数据库及cBioPortal数据库schulze2015队列分别获取376例和243例HCC患者全外显子测序数据,从ICGC数据库获取JP队列394例及FR队列250例HCC患者全基因组测序数据.采用生存分析研究TMB、关键信号通路的基因变异与HCC患者预后的关系.结果 TCGA队列、JP队列、sehulze2015队列和FR队列中,对数转换后的TMB与年龄均呈正相关(P＜0.001);在schulze2015队列中,对数转换后的TMB与肿瘤大小呈正相关(r=0.204,P=0.002).在TCGA队列中,与低TMB组比较,高TMB组HCC患者的OS(P＜0.001)及DFS(P=0.088)均明显降低,高TMB组HCC患者的死亡风险是低TMB组的2.156倍(P＜0.001).JP队列和FR队列均未发现TMB与OS及DFS有统计学意义.TCGA队列、JP队列和FR队列中,细胞周期调控通路基因变异的HCC患者中位DFS和中位OS均低于无变异的患者(P＜0.05),而复发风险和死亡风险均高于无变异患者(P＜0.05).结论 肿瘤突变负荷高和细胞周期调控通路的基因变异的HCC患者预后较差.