泛癌整合分析miR-200家族靶标肿瘤基因异质性的研究

• 作者: 刘海洲 刘萤照 吴健勇 唐勇 杨林凯 王琪 陈曦
• 来源期刊: 中国癌症防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: miR-200家族 靶标分子 泛癌 异质性
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 肿瘤生物信息学专栏
• 页码范围: 467-473
• 页数: 7页
• 分类号: R73
• 字数: 4211字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5671.2019.06.04

摘要

目的 探讨miR-200家族对不同肿瘤预后的影响及其靶标基因调控异质性的机制.方法 从癌症基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)下载泛癌研究项目(PanCanAtlas)中21种不同组织病理学恶性实体瘤样本的转录组数据和临床表型,并分析miR-200家族与肿瘤预后的关系.进一步选择生存风险评估结果互相矛盾的5种肿瘤进行miR-200家族靶标基因的WGCNA聚类分析.收集膀胱癌组织标本,采用免疫组织化学法和荧光定量PCR验证肿瘤组织中与miR-200家族表达显著相关的靶标基因的表达,并分析其对患者生存的影响.结果 miR-200家族高表达是膀胱癌和胃腺癌预后的保护因素(HR=0.55～0.68,P=0.0001～0.0340;HR=0.61～0.72,P=0.0055～0.0170),是肝细胞癌和胸腺瘤预后的不利因素(HR=1.46～1.65,P=0.0061～0.0120;HR =7.44～13.04,P=0.0002～0.0210);miR-141和miR-429对肾乳头状细胞癌生存的影响相反.基因聚类分析显示,miR-200家族靶标TIMP2基因表达可延长膀胱癌患者生存时间,miR-141负调控肾乳头状细胞癌EPHA2基因而延长患者生存时间.膀胱癌组织的TIMP2蛋白与miR-200家族表达呈负相关,miR-200家族高表达患者预后较好.结论 miR-200家族对不同肿瘤预后的影响存在异质性,可能是miR-200家族靶标分子在不同肿瘤的表达存在差异,导致miR-200家族调控生物学功能的异质性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐勇	南宁广西医科大学附属武鸣医院泌尿科	3	5	2.0	2.0
2	刘海洲	南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部	2	15	1.0	2.0
3	陈曦	南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部	1	0	0.0	0.0
4	吴健勇	南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部	1	0	0.0	0.0
5	刘萤照	南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部	2	2	1.0	1.0
6	杨林凯	南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部	1	0	0.0	0.0
7	王琪	南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部	2	10	1.0	2.0