葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析

• 作者: 刘兴满 王丽丽 葛金涛 赵统利
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 miR159 基因家族 分子进化 靶基因预测
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺园林
• 页码范围: 21-25
• 页数: 5页
• 分类号: S663.1
• 字数: 3498字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19386/j.cnki.jxnyxb.2018.02.05

摘要

为了研究葡萄miR159基因家族在葡萄生长发育过程中发挥的作用,利用生物信息学工具和方法,对葡萄miR159家族成员进行了基因定位、前体序列二级结构预测、成熟序列保守性分析、靶基因及其功能预测以及系谱进化分析.结果显示:在葡萄miR159家族成员中vvi-miR159a和vvi-miR159b两个成员均分布在染色体15上,vvi-miR159c分布在染色体17上;葡萄miR159家族成员基本上符合进化规律;葡萄miR159家族成员的前体均可形成稳定的茎环结构,且其成熟序列都产生于其前体茎环结构的5′端臂上,其碱基序列保守性较高;葡萄miR159家族对应的靶基因主要有两个(GSVIVT01012447001与GSVIVT01037362001),经BLAST分析,主要为GAMYB转录因子家族.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵统利		11	19	3.0	4.0
2	王丽丽		5	17	2.0	4.0
3	葛金涛		7	49	3.0	7.0
4	刘兴满		8	49	2.0	7.0