葡萄GRAS基因家族生物信息学分析

• 作者: 孙欣 慕茜 房经贵 王晨 王西成
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 拟南芥 GRAS基因家族 氨基酸序列 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 园艺园林
• 页码范围: 1-8
• 分类号: S663.1
• 字数: 4616字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8581.2011.07.001

摘要

为研究葡萄中GRAS基因家族的特征,本文首先利用生物信息学方法对葡萄91条GRAS蛋白序列的系统发生和GRAS基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了葡萄与拟南芥的GRAS基因家族之间的联系.结果显示这91条蛋白序列与拟南芥35个GRAS基因蛋白序列一起分成了8个亚族,说明拟南芥与葡萄GRAS基因间具有较高的保守性.基因组定位结果发现91条GRAS基因分布在17条染色体上.研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异；而二级结构预测结果发现,91条氨基酸序列以α-螺旋和随机卷曲为主要组成部分,且91条氨基酸序列三维结构相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	房经贵	南京农业大学园艺学院	194	3087	29.0	47.0
2	王西成	南京农业大学园艺学院	14	170	8.0	13.0
3	王晨	南京农业大学园艺学院	69	628	15.0	22.0
4	孙欣	南京农业大学园艺学院	17	181	10.0	13.0
5	慕茜	南京农业大学园艺学院	14	165	9.0	12.0