基于高通量测序的土壤中ermF基因宿主细菌多样性分析

• 作者: 原尚奇 吴楠 田佳 解诗雨 黄志伟
• 来源期刊: 天津农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 抗生素抗性基因 土壤 高通量 多样性
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 土壤肥料与节水灌溉
• 页码范围: 53-56
• 页数: 4页
• 分类号: S963.91
• 字数: 2933字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6500.2019.11.011

摘要

为探究土壤环境中抗生素抗性基因宿主微生物的多样性,本研究以天津地区的农田土壤为研究对象,利用高通量测序技术对土样中大环内酯类抗性基因ermF的宿主细菌在不同分类水平的多样性进行了评估.土样中宿主细菌种类覆盖9个门,39个科,42个属.4个土样之间所共有的OTUs只占总OTUs数目的0.5％,说明样品间宿主细菌群落的差异性显著,可能主要与采样地点不同有关.在所有土样中,ermF基因的优势宿主细菌在门的水平上均为拟杆菌门(Bacteroidetes,相对丰度50.3％～87.7％);同时检测到少量的变形菌门(Proteobacteria),放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),占比均小于4.2％.土样中ermF优势宿主细菌在科水平上都为拟杆菌科(Bacteroidaceae,相对丰度50.3％～87.5％),在属水平上都为拟杆菌属(Bacteroides,相对丰度50.3％～87.5％),其中相对丰度大于0.1％的ermF的宿主菌属有14种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴楠	天津农学院工程技术学院	16	27	3.0	4.0
2	田佳	天津农学院工程技术学院	3	0	0.0	0.0
3	解诗雨	天津农学院工程技术学院	3	0	0.0	0.0
4	黄志伟	天津农学院工程技术学院	2	0	0.0	0.0
5	原尚奇	天津农学院工程技术学院	2	0	0.0	0.0