扬州市儿童腹泻样本中<em>3</em>株salivirus病毒基因组特征分析

• 作者: 唐震 崔仑标 庞正 张倩 徐勤 朱凤才 朱小娟 王祥喜 王艳 苏璇 赵康辰 郑东宇
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: salivirus 病毒 基因组 分子进行特征
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 342-346
• 页数: 5页
• 分类号: R725.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2019.0084

摘要

目的 分析3株salivirus病毒基因组特征,为了解我国salivirus病毒分子进化特征提供数据.方法 对2018年扬州市儿童腹泻病例中3份salivirus病毒检测阳性的样本核酸进行高通量测序,获得该病毒的全基因组,应用MEGA 7.0软件构建系统进化树,通过MegAlign软件对核苷酸及编码区氨基酸序列进行同源性分析.结果 3株salivirus病毒均属于salivirus A1亚型,病毒之间基因组核苷酸及编码区氨基酸同源性均为99.4％～99.7％.与匈牙利毒株Hu/Baja-5332/2013/HUN/Salivirus A的同源性最高,核苷酸和编码区氨基酸同源性分别为96.5％～96.7％及98.0％～98.1％,处于同一进化分支.3株salivirus与国内salivirus A1亚型毒株的核苷酸和编码区氨基酸同源性分别为94.2％～95.2％及95.2％～97.1％;与国外salivirus A1亚型的核苷酸和编码区氨基酸的同源性分别为89.7％～96.7％及95.0％～ 98.5％,与国外salivirus A2亚型的核苷酸和编码区氨基酸的同源性分别为81.8％～～81.9％及88.3％～88.4％.结论 3株salivirus病毒遗传进化特征不同于我国已报道的salivirus病毒,丰富了我国salivirus病毒的基因数据库.