一株野鸟源重组禽流感(H6 N1)病毒基因组分子特征分析

• 作者: 付恬 侯志军 吕欣孺 孙静 孙颖 张国钢 曾祥伟 李仪 李祥 杨思远 杨晓宇 柴洪亮 王亚君 王玉龙 陈丽霞 马天 马沛然
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 禽流感病毒 H6N1 序列分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 案例
• 页码范围: 451-464
• 页数: 14页
• 分类号: S855.3
• 语种: 中文

摘要

2017年在江苏省野生豆雁粪便中分离得到1株H6N1亚型禽流感病毒A/Anser faba-lis/Jiangsu/J746/2017(H6N1)(J746).本研究对J746进行了全基因组测序,并对其进行了遗传进化分析.遗传进化分析结果表明:与HA和NA基因同源性最高的毒株为A/wild waterfowl/Korea/F14-5/2016(H6N1),同源性为99.4％.HA基因与流行于韩国、日本和孟加拉的N1、N2、N8亚型毒株处于同一分支,NA基因与韩国野生水禽的H6、H7亚型毒株处于同一分支,PB2基因与中亚及东亚地区低致性病毒株处于同一分支,PB1基因和NP基因与流行在东南亚的低致病性毒株处于同一分支,PA基因和M基因均处于欧亚分支,但PA形成了独立的小分支,NS基因与分离于中国中南部和日本的毒株聚集在一起.氨基酸位点分析表明,神经氨酸(NA)蛋白存在H274Y突变,该突变可增强病毒对神经氨酸酶抑制剂药物的耐药性;同时在PB2蛋白中发现与增强对小鼠致病性有关的L89V突变,在NS1蛋白中发现与增强对小鼠致病性、提高复制能力和改变宿主嗜性有关的P42S、L103F、I106M、N205S突变.综上所述,J746毒株基因组构成来源复杂,是由多个国家和地区形成的一株多元重组病毒.