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西农萨能奶山羊TRIB3基因克隆及RNA干扰分析
西农萨能奶山羊TRIB3基因克隆及RNA干扰分析
作者:
吕明
李聪
潘坛
罗军
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
西农萨能奶山羊
TRIB3 (tribbles pseudokinase 3 gene)
基因克隆
生物信息学分析
RNA干扰
摘要:
TRIB3 (tribbles pseudokinase 3)是一类丝氨酸/苏氨酸激酶样蛋白,常作为脂质代谢的负调控因子参与胰岛素信号转导途径,调控机体的脂质代谢.本研究旨在获得西农萨能奶山羊(Capra hircus)TRIB3基因序列并阐明其结构,通过RNAi技术干扰TRIB3基因表达,初步探究其对奶山羊乳腺上皮细胞脂质代谢的影响.以西农萨能奶山羊乳腺组织为实验材料,利用RT-PCR方法对TRIB3基因进行克隆,并进行生物信息学分析,研究结果表明,奶山羊TRIB3基因完整CDS区为1 074 bp (GenBank No.MK158243),编码357个氨基酸;蛋白分子量为39.6 ku,等电点为7.8,为不稳定蛋白;TRIB3存在36个磷酸化位点,无信号肽和跨膜螺旋结构;同源性分析显示,西农萨能奶山羊与绵羊(Ovis aries)、牛(Bos taut)、小鼠(Mus musculus) TRIB3氨基酸序列同源性分别为99%、96%、71%,与绵羊亲缘关系最近.组织表达分析显示,TRIB3基因在奶山羊乳腺组织中显著高表达,其次是脂肪组织.将设计合成的siRNA转染乳腺上皮细胞,结果显示,干扰TRIB3基因表达可显著上调脂质代谢相关基因—过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor γ,PPARG)和二酰甘油酰基转移酶(diacylglycerol acyltransferase,DGAT1)的mRNA水平.上述结果提示TRIB3可能作为负调节因子参与乳腺上皮细胞的脂质代谢.本研究为后续开展TRIB3调控羊奶乳脂代谢的分子机理提供了基础资料.
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西农萨能奶山羊TRIB3基因克隆及RNA干扰分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
西农萨能奶山羊
TRIB3 (tribbles pseudokinase 3 gene)
基因克隆
生物信息学分析
RNA干扰
年,卷(期)
2019,(8)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
1392-1400
页数
9页
分类号
S813.3|S826.9+4|S827
字数
6250字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2019.08.007
五维指标
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农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
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8
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