可变剪接在肺腺癌预后中的价值

• 作者: 兰应武 唐福州 张世超 曾柱 欧阳燕 胡祖权
• 来源期刊: 贵州医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肺肿瘤 预后 肺腺癌 可变剪接 临床结果 核心基因
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1254-1261
• 页数: 8页
• 分类号: R734.2|R34
• 字数: 3085字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19367/j.cnki.1000-2707.2019.11.003

摘要

目的:探讨可变剪接在肺腺癌预后中的作用.方法:在TCGA数据库中收集474例肺腺癌组织的RNA-seq数据,绘制可变剪接图谱;通过单因素Cox回归分析确定肺腺癌中存活相关的剪接事件,再利用最小绝对收缩模型筛选用于监测存活的预后因子;收集5例肺腺癌患者的癌组织,采用PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测CHEK1、KIF23、MCM和FN1的mRNA亚型条带.结果:在肺腺癌中存在着大量的可变剪接事件并与预后相关,包括CHEK1、KIF23、MCM7和FN1,通过生物信息学利用可变剪接事件构建了高效的风险预测模型;KEGG途径分析表明,主要富集的基因与““regulation of autophagy”、“central carbon metabolism in cancer”和“cell cycle”有关;5例肺腺癌患者的癌组织PCR扩增结果显示,可变剪接核心基因CHEK1、KIF23、FN1确实存在CHEK1-AP-19309、KIF23-AP-31390、FN1-ES-57398等剪接体.结论:可变剪接事件可作为预测肺腺癌患者临床结果的指标,可为肺腺癌患者制定个体化治疗方案提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾柱	贵州医科大学基础医学院	28	17	3.0	3.0
2	胡祖权	贵州医科大学生物与工程学院	20	19	2.0	3.0
3	唐福州	贵州医科大学生物与工程学院	8	6	2.0	2.0
4	张世超	贵州医科大学生物与工程学院	1	0	0.0	0.0
5	欧阳燕	贵州医科大学生物与工程学院	1	0	0.0	0.0
6	兰应武	贵州医科大学生物与工程学院	1	0	0.0	0.0