肺腺癌增强子调控miRNA前馈环路的识别与功能分析

• 作者: 岳俊杰 李志学 梁子涵 漆宇骋 贾承霖 郭志云
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 肺腺癌 增强子 转录因子 microRNA 前馈环路
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 740-745
• 页数: 6页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3854字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2019.06.002

摘要

目的:先前研究表明前馈环路作为重要的调控模式广泛参与肿瘤调控.通过整合多组学数据,阐明肺腺癌转录因子(TF)-增强子-miRNA这一新的前馈环路模式,以期为肺癌的潜在肿瘤标志物识别与相关研究提供理论与方法依据.方法:基于增强子数据库HACER,获取肺腺癌组织特异性增强子并识别TF-增强子、增强子-miRNA、TF-miRNA作用关系,利用超几何检验构建TF-增强子-miRNA前馈环路.通过mirTarBase数据库获取前馈环路的靶基因,分别对靶基因进行GO和KEGG功能富集分析,并对前馈环路的关键基因进行生存分析.筛选前馈环路关键miRNA,并对关键miRNA进行基因调控网络分析.结果:共识别了36条TF-增强子-miRNA前馈环路,功能富集结果显示肺腺癌前馈环路涉及的高表达miRNA(hsa-miR-6734、hsa-miR-210、hsa-miR-4677和hsa-let-7i)在细胞周期、细胞分化、能量代谢和糖代谢等方面具有重要功能,并显著富集于细胞增殖相关的糖代谢与氨基酸代谢通路中.生存分析结果表明前馈环路的多效靶基因TP53、CREB1、STAT5B、TPR的表达差异显著影响肺癌患者的生存时间.结论:TF-增强子-miRNA前馈环路靶基因广泛参与肺癌发生发展相关生物学功能和代谢通路,其调控的多效靶基因TP53、CREB1、STAT5B、TPR表达差异对肺癌患者的生存发展有显著影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭志云	西南交通大学生命科学与工程学院	14	41	4.0	6.0
2	李志学	西南交通大学生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
3	梁子涵	西南交通大学生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
4	贾承霖	西南交通大学生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
5	漆宇骋	西南交通大学生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
6	岳俊杰	军事科学院军事医学研究院生物工程研究所	1	0	0.0	0.0