猪流行性腹泻病毒YZ2016全基因组测序与稳定性分析

• 作者: 兰敏 张云航 张阔 王先炜 王咪 詹晶
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 分离鉴定 全基因组测序 序列分析
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 895-903
• 页数: 9页
• 分类号: S852.659.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.16656/j.issn.1673-4696.2019.0090

摘要

2016年我国江苏扬州某规模化养猪场暴发严重腹泻,本实验室通过RT-PCR确定其病原为猪流行性腹泻病毒(PEDV).将阳性样品接种Vero细胞,盲传5代后出现典型病变,并通过RT-PCR及间接免疫荧光试验确定成功分离到PEDV毒株,命名为PEDV YZ2016.采用分段重叠法对分离株基因组扩增测序,获得其全长序列.遗传进化分析显示PEDV YZ2016与近年流行毒株亲缘关系较近,与经典毒株亲缘关系较远.PEDV YZ2016与BJ-2011-1、LZW全基因组核苷酸序列一致性可达99.2％,与BJ-2011-1、OKN-1/JPN/2013 S基因推导氨基酸序列一致性可达98.5％.此外,分离株S基因发生多处点突变,导致其抗原表位及糖基化位点均发生部分改变.同时,序列比对分析显示不同代次的S、ORF3、N基因核苷酸突变率均极低.结果 表明,本研究分离的PEDV YZ2016株属流行变异毒株,且在传代过程中遗传稳定性良好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王先炜		58	439	11.0	19.0
2	王咪		1	0	0.0	0.0
3	张云航		1	0	0.0	0.0
4	张阔		1	0	0.0	0.0
5	兰敏		1	0	0.0	0.0
6	詹晶		1	0	0.0	0.0