凝血因子Xa的S4口袋部分关键残基对利伐沙班结合的不同作用机制

• 作者: 徐沁 瞿思颖
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 凝血因子Xa 利伐沙班 S4口袋 分子动力学模拟 结合自由能
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 物理化学
• 页码范围: 1918-1925
• 页数: 8页
• 分类号: O641
• 字数: 5486字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7503/cjcu20190261

摘要

通过生物信息学对比、分子动力学模拟和结合自由能计算分析了利伐沙班与凝血因子Xa的S4口袋部分关键残基之间动态相互作用的细节.结果表明,利伐沙班与凝血因子Xa结合不稳定是由S4口袋关键残基突变对疏水盒子完整性的破坏所致.其中Trp215侧链的疏水作用对抑制剂结合的作用较大,但对整体结构的影响短时间内较小.Tyr99虽然在结合自由能中贡献较小,但其突变可能导致99 loop所在结构域的整体构象变化,从而对于抑制剂或底物的结合特异性产生影响.S4口袋关键残基的不同作用在凝血因子Xa直接抑制剂的药物设计及其拮抗剂的开发中应予以充分考虑.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐沁	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室	2	7	1.0	2.0
2	瞿思颖	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室	1	1	1.0	1.0