帕金森病和抑郁症转录组生物信息学分析

• 作者: 傅锦华 刘丽妮 彭红莉 曹慧 杨栋 熊中杰 董轩萁 魏宏萍 黄卫
• 来源期刊: 国际神经病学神经外科学杂志
• 关键词: 帕金森病 抑郁症 转录组学 富集聚类
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 40-44
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16636/j.cnki.jinn.2019.01.009

摘要

目的 抑郁症状(MDD)是帕金森病(PD)常见的非运动症状,探讨帕金森病和抑郁症可能具有的共同致病机制.方法 通过文本挖掘及转录组数据分析帕金森病与抑郁症共同的致病机制.结果 文本挖掘发现63.8％的MDD基因和32％的PD基因为共有基因及438个共有的生物学过程;转录组筛选出有统计学意义的10个共同差异基因:Ⅰ类肌球蛋白(MYO1F)、活化免疫球蛋白样受体(LILRA2)、垂体腺苷酸环化酶激活多肽(ADCYAP1)、骨骼肌肌球蛋白轻链激酶(MYLK2)、钙结合蛋白2(CLSTN2)、钙调蛋白依赖性蛋白激酶4(CAMK4)、前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶1(PCSK1)、瞬时受体电位阳离子通道5(TRPC5)、钠离子葡萄糖联合转运子(SLC5 A1)、酪氨酸酶相关蛋白1(TYPR1) (P＜0.01);基因功能富集分析发现PD和MDD具有相同的14个生物学过程,6个细胞组成,10个分子功能,并且有3个相同的京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路(P＜0.05);通过蛋白质网络构建,筛选出4个共同的关键基因(MYO1F、CAMK4、PCSK1、TRPC5);通过对蛋白质网络模块分析后发现关键模块具有共同的生物学过程.结论 帕金森病和抑郁症具有共同的致病基因及通路,这为帕金森病和抑郁症伴存现象提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭红莉		10	28	2.0	5.0
2	杨栋		12	58	3.0	7.0
3	傅锦华		11	107	5.0	10.0
4	刘丽妮		4	3	1.0	1.0
5	黄卫		6	19	3.0	4.0
6	魏宏萍		2	6	1.0	2.0
7	曹慧		6	1	1.0	1.0
8	熊中杰		1	0	0.0	0.0