长非编码RNA与SAFB1相互作用中 RNA二级结构的作用

• 作者: 吴传芳 李晓杰 王琳琳 王迪 缪辉 詹浩淼
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: RNA SAFB1蛋白 RNA二级结构 亚克隆 凝胶迁移率
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 743-748
• 页数: 6页
• 分类号: Q71
• 字数: 3641字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2019.04.026

摘要

为探究RNA与SAFB1蛋白相互作用过程中RNA二级结构的作用.采用足迹法确定SAFB1与LINC-PINT-1特定的结合区域,在此基础上根据RNA结构分析研究SAFB1结合区域所具有特定的二级结构.最后通过凝胶迁移率实验论证该二级结构在RNA与SAFB1蛋白结合中的作用.结果显示:在针对LINC-PIN T-1的亚克隆发现只有包含30～55 nt区域的亚克隆才能维持RNA结合区域的二级结构,并且证实了LINC-PINT-1与SAFB1蛋白相互作用依赖于特定的RNA二级结构.结果表明:长非编码RNA与SAFB1蛋白相互作用或依赖于特定的RN A二级结构,本研究为RN A与蛋白质相互作用的分子机制研究提供了有力的理论实验支撑.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴传芳	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	40	140	6.0	11.0
2	王迪	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	31	26	2.0	5.0
3	王琳琳	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	5	7	2.0	2.0
4	李晓杰	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	4	1	1.0	1.0
5	缪辉	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	3	2	1.0	1.0
6	詹浩淼	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	1	0	0.0	0.0