10株猪流行性腹泻病毒云南分离株的S基因克隆及分子特征

• 作者: 吕念词 张以芳 张天羽 朱丽 柴俊 苏琳琳 赵翔玥 郑晓林 钱祁昇
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 PEDV S基因 分子特征 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 101-107
• 页数: 7页
• 分类号: S852.6
• 字数: 5229字
• 语种: 中文

摘要

自2013年来,猪流行性腹泻病(PED)的暴发给云南省养猪业带来严重的经济损失.本研究对2018年来自云南4个地区的42份病料中分离出的6株猪流行性腹泻病毒(PEDV)的部分S基因进行扩增,并结合在2013年所分离到的来自云南4个地区的4株PEDV流行株,进行分子特征和遗传进化分析.结果 显示:这2年的分离株和CV777株相比,2018年分离株的核苷酸和氨基酸突变位点增加了12个和7个,且有3个丝氨酸突变都是在COE结构域(69、101和146).系统发育分析表明,2018和2013年分离株的核苷酸和氨基酸的同源性为95.6％～ 98.8％,95％～98.8％;分别与CV777株相比,核苷酸和氨基酸的同源性差异较小(94.9％～95.5％和92.7％～95.4％;94.5％～95.2％和93.4％～94.2％),亲缘关系都较远.2013年的分离株主要分布在G2b亚群,而2018年的分离株主要分布在G2a和G2c亚群,具有遗传多样性.N-糖基化和磷酸化位点预测分析显示,在216位上预测的N-糖基化位点由NSSI→NSSF,尤其是COE结构域中的丝氨酸取代而导致其可预测磷酸化.这些变异很可能会影响其抗原性和疫苗效果,导致PEDV控制效果不好.本研究阐明了云南部分地区PEDV流行毒株的分子流行病学和遗传特征,为该地区PED的防控奠定理论基础.