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摘要:
目的 利用数据库分析肝细胞癌(HCC)组织核转运蛋白XPO5基因水平及其与患者预后的关系.方法 在Oncomine数据库,分析HCC组织XPO5基因水平,并在GEPIA数据库中选择TCGA数据进行验证.在MethHC数据库分析HCC组织XPO5基因甲基化水平.在GEPIA的TCGA数据库,分析XPO5基因水平对HCC患者生存期的影响以及不同病理学分级的HCC组织XPO5基因水平差异.在STRING数据库分析与XPO5相互作用的蛋白种类.结果 与正常肝组织比,HCC组织XPO5基因呈高水平(P<0.01),且在病理学分级为III级组织XPO5基因水平最高;HCC组织XPO5基因高水平患者总体生存期和无病生存期较低水平患者显著缩短,差异具有统计学意义(P<0.01);HCC组织XPO5基因较正常肝组织甲基化水平显著降低,差异具有统计学意义(P<0.005),甲基化降低区域主要位于基因体区域;蛋白相互作用网络分析显示,XPO5与DICER1和RAN等蛋白相互作用,并参与了miRNA的调控.结论 XPO5基因在HCC组织中呈高水平状态,这种高水平状态可能与癌组织不同病理学分级有关,并影响患者的生存期.采用数据库进一步挖掘分析研究结果可能为临床采用生物学方法HCC患者提供参考依据.
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文献信息
篇名 基于数据库分析肝细胞癌细胞XPO5基因水平变化及其临床意义
来源期刊 实用肝脏病杂志 学科
关键词 肝细胞癌,XPO5 病理学分级 生存期 数据库
年,卷(期) 2019,(5) 所属期刊栏目 肝癌
研究方向 页码范围 724-727
页数 4页 分类号
字数 3065字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5069.2019.05.028
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刁勇 福建省泉州市华侨大学医学院 2 2 1.0 1.0
2 赵洪波 昆明医科大学分子临床医学研究院 10 18 2.0 3.0
3 王刚 福建省泉州市华侨大学医学院 1 1 1.0 1.0
4 朱亚玲 福建省泉州市华侨大学医学院 1 1 1.0 1.0
5 蒋保三 福建省泉州市华侨大学医学院 1 1 1.0 1.0
6 张越美 福建省泉州市华侨大学医学院 1 1 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
肝细胞癌,XPO5
病理学分级
生存期
数据库
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
实用肝脏病杂志
双月刊
1672-5069
34-1270/R
大16开
合肥市长江西路424号
26-201
1996
chi
出版文献量(篇)
4015
总下载数(次)
5
总被引数(次)
25632
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