小细胞肺癌关键基因及信号通路分析

• 作者: 姜朋媛 徐芃芃 朱世杰 李林潞 毛昀 蔡亚芳 薛鹏 褚雪镭
• 来源期刊: 肿瘤防治研究
• 学科: 医学
• 关键词: 小细胞肺癌 差异表达基因 生物信息学 蛋白互作网络
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 683-689
• 页数: 7页
• 分类号: R734.2
• 字数: 3926字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2019.18.2039

摘要

目的 探究SCLC基因调控机制,为寻找SCLC早期诊断及靶向治疗潜在的生物标志物提供依据.方法 采用生物信息学方法从公共基因芯片数据库获取小细胞肺癌(SCLC)mRNA数据并筛选出差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体(GO)和基因组百科全书数据库(KEGG)富集分析,构建蛋白互作网络,筛选出核心基因并利用Kaplan-Meier在线工具进行生存分析.结果 17例SCLC组织样本和19例正常肺组织样本中筛选出248个DEGs,包括172个高表达基因和76个低表达基因(P<0.05).GO和KEGG富集分析结果显示,DEGs的功能主要涉及细胞周期、DNA复制、错配修复、P53信号通路等,蛋白互作分析网络筛选出6个节点度最高的核心基因:TOP2A、PCNA、RFC4、FEN1、CCNA2和MCM2,并与患者预后相关.结论 DEGs涉及的分子功能和信号通路可能是SCLC发生的分子机制,而核心基因可能是治疗SCLC的潜在靶点.