三角帆蚌HcTyp-1基因珍珠层颜色性状相关SNP筛选及图谱定位

• 作者: 李家乐 白志毅 陈夏君 韩学凯
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三角帆蚌 HcTyp-1 珍珠层颜色 SNP 相关性
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 467-473
• 页数: 7页
• 分类号: Q785|S966.22+1
• 字数: 4135字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20171111066

摘要

本实验室根据前期研究发现,Hc Typ-1基因可能参与了三角帆蚌贝壳珍珠层颜色的形成.本实验根据Hc Typ-1基因cDNA设计引物,比较筛选获得了8个SNP位点并分析了这些位点与内壳色的相关性,然后对Hc Typ-1基因进行了图谱定位.通过研究这些多态性位点与贝壳珍珠层颜色性状相关性发现,C+3057T位点基因型仅在a参数上存在显著差异,G+2985T和T+3006C 2个位点基因型分别在L、b及a、dE上存在显著差异,A+2834C、C+2919T和G+2986T这3个SNPs位点基因型在L、a及dE上均存在显著差异.连锁不平衡结果显示,Hc Typ-1基因上除C+2912T、C+2983A这2个位点,其他6个位点具有显著差异,位点之间都存在强连锁不平衡.单倍型分析结果显示,单倍型T2和T4在白色群体中出现的频率极显著高于在紫色群体中出现的频率,T6和T8两种单倍型在紫色群体中出现的频率极显著高于白色群体.因此Hc Typ-1基因的部分SNPs可作为三角帆蚌不同内壳色贝壳辅助育种的候选分子标记位点.另外,本研究还将Hc Typ-1基因定位在三角帆蚌LG16连锁群上,这为进一步解析该基因调控珍珠颜色形成的分子机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李家乐	上海海洋大学农业部淡水种质资源重点实验室	91	1011	19.0	27.0
5	白志毅	上海海洋大学农业部淡水种质资源重点实验室	36	253	9.0	14.0
9	韩学凯	上海海洋大学农业部淡水种质资源重点实验室	5	53	4.0	5.0
10	陈夏君	上海海洋大学农业部淡水种质资源重点实验室	2	8	2.0	2.0