应用高通量测序技术与荧光PCR技术检测肺腺癌驱动基因变异分析

• 作者: 俞训彬 晋龙 林洁 陈小岩 陈灵锋
• 来源期刊: 中华病理学杂志
• 关键词: 肺肿瘤 DNA突变分析 高通量核苷酸测序 聚合酶链反应
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 772-778
• 页数: 7页
• 字数: 6663字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0529?5807.2019.10.005

摘要

目的 分析高通量测序技术与荧光PCR技术检测肺腺癌驱动基因变异的特点.方法采用高通量测序技术检测福建省立医院2015年1月至2017年1月间372例原发性肺腺癌手术切除样本的10个驱动基因变异(仅检测点突变、插入、缺失和融合基因,未检测拷贝数变异),并采用荧光PCR技术对福建省立医院2013年4月至2015年4月间169例肺腺癌样本进行9个驱动基因热点突变检测,根据指南和OncoKB数据库对检测到突变丰度≥1.0%的突变位点进行分类,分析驱动基因变异的特点.结果 高通量测序技术检测到67种突变形式(Ⅰ类、Ⅱ类、ⅢA类、ⅢB类和Ⅳ类),突变总阳性率为86.6%(322/372),Ⅰ类突变(美国食品药品管理局或国家药品监督管理局批准用于非小细胞肺癌的用药治疗靶点)阳性率为71.2%(265/372);Ⅱ类突变(写入中外诊疗指南有明确诊断/治疗/预后意义的变异或已经写入该领域的专家共识的变异位点)阳性率3.0%(11/372);ⅢA类突变(令人信服的临床证据预测对非小细胞肺癌靶向药物的反应)阳性率为3.0%(11/372);ⅢB类突变(令人信服的临床证据用于其他肿瘤可预测疗效的基因变异)阳性率为4.3%(16/372);Ⅳ类突变(令人信服的生物学证据预测对非小细胞肺癌靶向药物的反应)阳性率为8.1%(30/372);临床意义不明的变异和可能是良性的变异阳性率为18.8%(70/372).荧光PCR技术检测169例肺腺癌样本中驱动基因热点突变(Ⅰ类、Ⅱ类、Ⅲ类和Ⅳ类)总阳性率为81.7%(138/169).对于高通量测序技术与荧光PCR技术均检测的20例原发性肺腺癌手术切除样本检测结果,18例结果一致,2例不一致是由于荧光PCR技术采用的试剂盒未涵盖这2个突变位点:EGFR基因c.2571_2573delinsTCG(p.L858R)和ALK融合基因HIP1?ALK_H19:A20 fusion.结论 肺腺癌驱动基因变异主要发生在热点区域,高通量测序技术可较全面地检测出肺腺癌驱动基因中具有显著临床意义和潜在临床意义的突变位点,需要检测多个驱动基因时,推荐使用高通量测序技术.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林洁	福建医科大学省立临床医学院福建省立医院病理科	32	143	6.0	10.0
2	陈小岩	福建医科大学省立临床医学院福建省立医院病理科	43	122	6.0	8.0
3	陈灵锋	福建医科大学省立临床医学院福建省立医院病理科	5	10	2.0	3.0
4	俞训彬	福建医科大学省立临床医学院福建省立医院病理科	7	28	3.0	5.0
5	晋龙	福建医科大学省立临床医学院福建省立医院病理科	17	49	4.0	6.0