PCR-HRM方法分析16S rRNA基因进行细菌鉴定的可行性研究

• 作者: 任微 杨婧 王佳琳 薛文成 邱会茹
• 来源期刊: 现代检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 细菌感染 细菌鉴定 高分辨熔解曲线 16S rRNA
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 37-41
• 页数: 5页
• 分类号: R378|Q503
• 字数: 3693字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7414.2019.03.009

摘要

目的 建立一种基于16S rRNA基因进行聚合酶链式-高分辨率熔解曲线(PCR-HRM)分析方法,用于快速鉴定临床常见感染细菌.方法 收集中国人民解放军北部战区总医院2017年8月～2018年10月期间临床分离的167株常见细菌,选取16S rRNA三个高度保守区域(V1,V3,V6)基因序列用于引物设计,在含有饱和荧光染料的体系中进行PCR-HRM分析以区分不同细菌种属.将167株实验菌分为葡萄球菌、链球菌、非发酵阴性杆菌以及其它常见临床分离菌四组进行实验,分别进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和PCR-HRM分析并对结果进行对比,不一致的鉴定结果以测序为金标准.同时进行PCR-HRM方法鉴定临床常见病原菌的灵敏度、重复性和盲法验证试验.结果 PCR-HRM方法与MA[LDI-TOF MS对167株临床常见分离菌鉴定正确率分别为98.2％和97.0％,这两种方法无明显统计学差异(x2=1.97,P=0.727＞0.05).PCR HRM方法可检测2pg/μl的模板浓度;将6株革兰阴性菌分成一式三份同时进行PCR-HRM重复性试验,同种实验菌的三份熔解曲线因完全聚类;其盲法验证实验准确率100％.结论 该方法通过使用3对16S rRNA引物构造多重差异曲线可对临床常见细菌进行分类到属级甚至种级,且灵敏度高、特异度强,可以作为鉴定临床常见感染菌的新选择.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛文成	北部战区总医院检验科	1	2	1.0	1.0
2	杨婧	北部战区总医院感染控制科	2	2	1.0	1.0
3	任微	北部战区总医院检验科	1	2	1.0	1.0