猪VRTN基因SINE转座子插入多态与生长和繁殖性状的关联分析

• 作者: 宋成义 张丽 沈丹 王伟 王宵燕 王赛赛 陈伟 陈才 高波
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大白猪 椎骨发育相关(VRTN)基因 短散在重复序列(SINE) 多态性 关联分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 464-470
• 页数: 7页
• 分类号: S828.8
• 字数: 4795字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.03.010

摘要

椎骨发育相关基因(vertebrae development associated,VRTN)是动物椎骨发育的重要调控基因,研究表明猪(Sus scrofa domesticus)VRTN基因中存在一个短散在重复序列(short interspersed repeated sequence,SINE)的插入多态,该多态可能与猪的脊椎数关联.本研究通过PCR检测、性状关联分析和生物信息学分析等研究了SINE插入多态在不同品种间的分布及其对猪生长和繁殖性状的影响.结果表明,引入品种SINE+频率高于培育猪种和中国地方猪种,大白猪SINE+/+个体100 kg体重日龄显著高于SINE-/-个体(P＜0.05),大白猪SINE+/+个体眼肌面积显著低于SINE-/-个体(P＜0.05).产活仔数等繁殖性状与SINE插入多态无显著关联.经与表达序列标签(expressed sequence tag,EST)等数据库序列比对未发现SINE与VRTN基因形成融合转录本.本研究表明VRTN基因中SINE插入多态可能与猪生长速度和瘦肉率有关联,此结果为该分子标记在猪分子育种中的应用提供了参考.