miR-127-3p对C2C12细胞成肌分化和转录组的影响

• 作者: 付琳 任航行 周鹏 宋天增 李杰 王高富 蒋婧 马友记 马金英
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: RNA-Seq microRNA 过表达 C2C12 成肌分化
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 页码范围: 8-16
• 页数: 9页
• 分类号: S826
• 字数: 5451字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2019.01.002

摘要

前期研究表明,miR-127-3p参与骨骼肌细胞分化的调控,但对于miR-127-3p调控的靶基因及其在成肌分化中的作用还不清楚.应用qRT-PCR与细胞形态学方法研究过表达miR-127-3p对C2C12成肌细胞分化及成肌标志基因MyoD、MyoG和Myosin表达的影响;RNA-Seq分析过表达miR-127-3p对成肌细胞转录组的影响,鉴定差异表达基因并对其功能进行初步研究.结果表明,过表达miR-127-3p显著促进C2C12细胞的成肌分化与MyoD、MyoG和Myosin表达;RNA-Seq分析共鉴定到3个差异基因,均为下调基因,其中包括2个转录因子(Irf7和Ddit3).GO与KEGG分析显示,这些差异基因显著富集于免疫和能量代谢过程/信号通路.生物信息学分析发现,miR-127-3p可与Ddit3基因的CDS区发生碱基互补配对,进而抑制其表达.表明在转录组水平上,miR-127-3p可能通过直接靶向Ddit3基因/转录因子调控免疫与能量代谢类基因的表达,进而调节成肌细胞分化.