基于GEO数据库对脑梗死相关差异基因的分析研究

• 作者: 姜希娟 徐彦龙 杨小燕 杨正飞 郭茂娟
• 来源期刊: 吉林中医药
• 学科: 医学
• 关键词: GEO数据库 脑梗死 差异基因 富集分析 基因芯片
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1638-1641
• 页数: 4页
• 分类号: R743
• 字数: 1997字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13463/j.cnki.jlzyy.2019.12.028

摘要

目的 比较模型组(MCAO组)大鼠与假手术组(Sham组)大鼠脑组织的差异基因,分析差异基因影响的功能通路,为脑梗死的治疗提供可行的研究方向和具体的作用靶点.方法 在GEO数据库下载MCAO组大鼠与Sham组大鼠脑组织中的表达谱芯片,并通过R软件得到差异基因;利用DAVID 6.8分析差异基因的GO功能富集和KEGG通路富集.结果 通过分析得到148差异表达基因,123条GO富集通路,主要涉及药物反应、脂多糖反应、炎症反应、有机环状化合物反应及细胞外基质等生物过程,并与蛋白结合、受体结合、蛋白质同源化活性、整合素结合、蛋白酶结合及趋化因子的活性等分子功能相关;KEGG通路富集分析,得到显著性富集通路23条,涉及TNF信号通路、NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路和HIF-1信号通路等.结论 TNF信号通路与NF-κB信号通路可能是治疗脑梗死的行之有效的干预方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜希娟		116	582	11.0	18.0
2	郭茂娟		80	469	12.0	17.0
3	徐彦龙		20	176	8.0	13.0
4	杨正飞		11	26	4.0	5.0
5	杨小燕		4	0	0.0	0.0