基于GEO数据库的DPN相关靶点挖掘及与芍药苷分子对接研究

• 作者: 刘征 李伟 江雅琴 邢琪昌 陈佳
• 来源期刊: 广东药科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 基因表达综合数据库 糖尿病周围神经病变 靶点 芍药苷 分子对接
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 药理学
• 页码范围: 514-518
• 页数: 5页
• 分类号: R285.5
• 字数: 3012字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16809/j.cnki.2096-3653.2020030602

摘要

目的 基于GEO数据库挖掘与糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)发生发展相关的潜在基因与靶点,并通过分子对接探讨芍药苷的干预作用.方法 从GEO数据库中收集DPN和糖尿病人群研究的全基因组微阵列共计12例.在GEO2R平台内对两组的数据做差异基因分析,将筛选出的差异基因导入STRING在线数据库,获得差异基因所编码的蛋白质之间的相互作用并分析筛选核心靶点.采用AutoDock VINA对芍药苷与上述筛选的核心靶点进行对接打分,并采用Western blot法检测芍药苷对mCCL2/CCR2激活的MAPK表达的影响进行验证.结果 通过GEO数据库筛选出DPN组相对于糖尿病组表达差异基因共计有132个,其中CCR2、TNF和BDNF处于蛋白相互作用网络核心位置,芍药苷与相应靶点对接分数分别为-8.0,-5.2和-5.0,具有较强亲和力,芍药苷能够抑制mCCL2/CCR2激活的MAPK表达.结论 芍药苷抗DPN机制可能与通过调节神经生长因子(BDNF)、调控趋化因子受体(CCR2)和促炎因子(TNF)以促进神经修复和减轻炎性疼痛有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈佳	湘潭市中心医院药学部	2	0	0.0	0.0
2	李伟	湘潭市中心医院药学部	15	12	2.0	3.0
3	刘征	湘潭市中心医院药学部	3	0	0.0	0.0
4	江雅琴	湘潭市中心医院药学部	2	0	0.0	0.0
5	邢琪昌	湘潭市中心医院药学部	2	0	0.0	0.0