分子传播网络技术在艾滋病传播性耐药检测中的应用

• 作者: 刘红露 叶黎 李一平 杨文 杨洪 杨淑娟 梁姝 苏玲 袁丹 阿皮拉则
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1) 耐药 传播性耐药检测 分子传播网络
• 年，卷（期）: 2019,（21）
• 所属期刊栏目: 疾病预防控制
• 页码范围: 4014-4017,4025
• 页数: 5页
• 分类号: R183
• 语种: 中文

摘要

目的 分析凉山州布拖县特木里镇、木尔乡和九都乡(后称“两乡一镇”)艾滋病耐药毒株传播情况,利用分子传播网络技术分析耐药毒株传播来源.方法 采集2017年布拖县两乡一镇新报告未治疗的HIV-1感染者的血浆样本,扩增HIV-1 pol基因区蛋白酶和逆转录酶1.2 kb片段,进行耐药分析,同时应用HyPhy2.2.4与Cytoscape3.6.1软件与凉山州近年接受治疗且耐药患者的序列构建分子网络,分析耐药传播情况.结果 在174份血样中获得119条(68.39％)有效分析序列,13例(10.92％)出现了耐药突变,其中CRF_ 08BC亚型毒株耐药率高于CRF_07BC亚型和C亚型毒株(X2=6.884,P=0.032),地区、年龄、职业、婚姻、文化和传播途径耐药率差异无统计学意义.在11例(84.62％) CRF_07 BC亚型毒株中,3例在分子网络中与治疗患者耐药序列成簇,2例K103N突变,1例Q58E突变,其中1例为家庭内传播,其余2例与成簇序列患者关系不详.结论 布拖县两乡一镇艾滋病耐药率较高,达到中度耐药传播水平,运用分子传播网络技术,能进一步发现新报告耐药患者毒株的传播来源.