基于ITS2序列的苍术属植物遗传关系

• 作者: 姜宇珺 孙建之 张北雪 才谦 马善鹏
• 来源期刊: 中国实验方剂学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 苍术属 关苍术 朝鲜苍术 内部转录间隔区2 (ITS2) 遗传关系 二级结构
• 年，卷（期）: 2019,（23）
• 所属期刊栏目: 资源与质量评价
• 页码范围: 171-175
• 页数: 5页
• 分类号: R284.1|R282.6|R22|R243
• 语种: 中文
• DOI: 10.13422/j.cnki.syfjx.20191913

摘要

目的:应用内部转录间隔区2(ITS2)序列鉴定东北产栽培和野生苍术及其近缘种药材,明确其种间遗传关系远近,并对东北产朝鲜苍术的栽培起源进行初步探索.方法:提取不同栽培区包括北苍术、朝鲜苍术在内的五种苍术属40份样本以及朝鲜苍术7份野生种质样本的基因组DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS2序列并进行双向测序,所得所有序列用MEGA5.0软件进行比对分析(clustal W),去除两端5.8S和28S序列,获得完整的ITS2序列,构建系统聚类树(NJ树).结果:苍术属5种药材ITS2序列长度均为232 bp.根据NJ树和ITS2二级结构结果,除北苍术和朝鲜苍术未被区分开,其余几种药材均可明显区分,表现出良好的单系性.根据NJ树结果可知,朝鲜苍术的栽培品系和野生种质也能很好的聚在一起.结论:ITS2序列能稳定、准确鉴别苍术属5种药材.朝鲜苍术与北苍术亲缘关系很近,可认为是苍术北方分支中的一种变种,建议将朝鲜苍术并入北苍术.且在辽宁有大规模栽培的朝鲜苍术可能起源于辽宁本地的野生群体,种源可能来自于辽宁岫岩等地的野生种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	才谦		107	658	14.0	21.0
2	孙建之		11	6	2.0	2.0
3	马善鹏		4	0	0.0	0.0
4	姜宇珺		4	0	0.0	0.0
5	张北雪		4	0	0.0	0.0