细粒棘球绦虫肌动蛋白抗原表位预测

• 作者: 张发斌 李凤辉 李超群 樊海宁 赵婧 高瑞雪
• 来源期刊: 中国高原医学与生物学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 细粒棘球绦虫 肌动蛋白 B细胞表位 T细胞表位
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 高原包虫病基础研究
• 页码范围: 106-110
• 页数: 5页
• 分类号: R383.33
• 字数: 1757字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13452/j.cnki.jqmc.2020.02.006

摘要

目的 对细粒棘球绦虫肌动蛋白(Echinococcus granulosus actin EgACT)的结构和抗原表位进行分析,为筛选疫苗候选抗原提供依据.方法 采用生物信息学技术分析EgACT的理化性质和亲/疏水性、柔性区域、抗原指数、表面可及性、可能的信号肽序列、跨膜结构区域、二级结构及优势抗原表位.结果 细粒棘球绦虫肌动蛋白由376个氨基酸组成,相对分子质量为41.95 kDa,等电点理论值为5.38,不稳定系数为39.28(稳定蛋白);亲水区域明显;柔性区域呈散在分布,较明显的分布区域位于12-30、37-42、57-63、79-85、107-118、195-208、232-240、282-293、312-319、360-368氨基酸区段;表面可及性得分较高的区域主要位于58-63、78-86、109-119、231-244、286-294、312-318、359-365氨基酸区段;抗原性指数得分较高区域与柔性区域的分布一致;无信号肽序列;无跨膜区;二级结构中的β转角占6.65％、α螺旋占37.5％、延伸链占21.28％、无规则卷曲占34.57％,优势B细胞表位位于14-29、52-61、77-82、233-242、285-290氨基酸区段,优势T细胞表位位于75-78、85-88、185-193、208-211、274-277、309-312氨基酸区段.结论 成功预测出细粒棘球绦虫的肌动蛋白抗原表位,可为筛选疫苗候选抗原提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	樊海宁	青海大学附属医院	161	488	10.0	13.0
3	张发斌	青海大学医学院	88	234	7.0	12.0
6	李超群	青海大学医学院	15	11	2.0	2.0
7	李凤辉	青海大学医学院	4	9	2.0	3.0
8	赵婧	青海大学医学院	5	7	1.0	2.0
9	高瑞雪	青海大学医学院	2	0	0.0	0.0