基于EST-SSR标记的野生榧树居群遗传多样性分析

• 作者: 唐海英 张敏 张迟 戴文圣 李杰峰 金航标 陈焘 高樟贵
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: EST-SSR 榧树 遗传多样性 遗传结构
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 224-231
• 页数: 8页
• 分类号: S791.53
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20200518.022

摘要

对野生榧树居群进行遗传多样性分析,有利于榧树野生资源的开发和利用.利用基于榧树(Torreya grandis)种仁转录组开发的36对多态性EST-SSR引物,对5个野生榧树居群共142个单株的遗传多样性进行分析.通过聚类分析、STRUCTURER遗传结构分析、分子方差分析(AMOVA)和主坐标分析(PCoA)等方法分析居群遗传结构.结果 表明,5个居群的平均等位基因数(Na)为4.285 7～6.638 9,Shannon's指数(Ⅰ)为1.015 0～1.373 6,Nei's遗传多样性指数(H)为0.532 7～0.656 1.36个SSR位点的平均遗传分化指数Fst为0.261 9,平均近交系数Fi.为0.398 1,平均基因流(Nm)为0.704 7.居群成对分析显示,除黄山-嵊州居群间以及嵊州-松阳居群间,其他居群间Fst均大于0.15,基因流大于1.分子方差分析表明5个榧树居群的遗传差异主要存在于居群内(72％).居群的遗传结构分析显示,黎川与松阳居群的遗传结构比较相似,而诸暨居群、嵊州居群及黄山居群等3个居群的遗传结构差异较大.5个野生榧树居群具有较高的遗传多样性,居群遗传结构的分析结果与各居群的地理分布基本一致.