人头颈鳞癌中ceRNA网络构建及表达趋势

• 作者: 刘法昱 张岚
• 来源期刊: 解剖科学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 乳颈部鳞癌 生物信息学分析 ceRNA
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 原著
• 页码范围: 143-145,149
• 页数: 4页
• 分类号: R739.91
• 语种: 中文
• DOI: 10.16695/j.cnki.1006-2947.2020.02.006

摘要

目的 分别比较4例HNSCC患者癌和癌旁组织的环状RNA、微小RNA和mRNA芯片表达谱,构建hsa_circRNA_103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15相关的ceRNA网络,探讨其表达趋势.方法 利用芯片筛选HNSCC组织中差异表达的circRNA、miRNA和mRNA基因,根据miRwalk3.0在线软件预测的结果,构建HNSCC中的circRNA/miRNA/mRNA-相关的ceRNA网络.采用qRT-PCR方法检测HNSCC组织中hsa_circRNA_103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15基因的表达.结果 芯片技术检测4例HNSCC患者癌和癌旁组织中差异表达的circRNA、miRNA及mRNA基因,获得显著差异的环状RNAs转录本311个,microRNAs转录本52个及circRNA433个.结合以上数据,构建了一个包含48种circRNAs,21种miRNAs和79种mRNAs的ceRNA网络并验证has-circRNA_103580、has-miR-9-5p与PRDM15的基因表达水平与芯片中表达趋势一致.结论 hsa_circRNA_103580/hsa-miR-9-5P/PRDM 15轴可能是HNSCC预后和治疗新的靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张岚		15	41	4.0	6.0
2	刘法昱		19	76	6.0	7.0