2014-2018年云南省文山州柯萨奇病毒A10型VP1区基因特征分析

• 作者: 伏晓庆 周晓芳 周雪花 寸建萍 李楠 田炳均 赵晓南
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒A10型 VP1基因 基因特征分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 109-113
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2+3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2020.0003

摘要

目的 对2014-2018年云南省文山州从手足口病病例中分离的柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CV-A10)完整VP1区基因(894 bp)进行基因特征分析.方法 用486/488和487/489引物扩增CV-A10 VP1区5'端和3'端基因,用Sequencher 4.0软件对序列进行拼接和编辑,得到CV-A10 VP1区全序,并将测得的序列与NCBI数据库中的序列进行比对,构建系统进化树,进行基因特征及分子流行病学分析.结果 2014-2018年云南省文山州手足口病实验室监测系统从2 774份标本中分离到197株肠道病毒阳性标本,病毒分离率为7.10％ (197/2 774),其中检出8株CV-A10.基于VP1分型,8株毒株序列均为基因型C,其中4株为分支1;2株为分支2;2株为分支3.8株毒株VP1序列的核苷酸一致性为93.07％～94.10％,氨基酸一致性为97.74％～ 98.41％,与原型株Kowalik(基因库编号:AF081300)的核苷酸一致性为76.01％～76.65％,氨基酸一致性为91.78％～ 92.26％.结论 2014-2018年云南省文山州分离的CV-A10毒株均为基因型C,并可分为3个进化分支,应加强对CV-A10的持续监测和基因特征分析.