猪圆环病毒3型河北株全基因组序列特征和遗传进化分析

• 作者: 李杰峰 杨威 段宝宁 王承玉 赵志强 马玉忠
• 来源期刊: 甘肃农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: PCV3 全基因组 序列特征 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学·动物医学
• 页码范围: 35-44
• 页数: 10页
• 分类号: S855.3
• 字数: 4331字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13432/j.cnki.jgsau.2020.01.006

摘要

[目的]扩增猪圆环病毒3型(PCV3)全基因组序列,对其进行序列特征及遗传进化分析.[方法]以PCV3阳性样品为模板,利用两对引物扩增全基因组片段并测序,通过DNA Star和MEGA-X软件进行遗传进化分析.[结果]发现1株新PCV3毒株(GenBank登录号:MK105924),PCV3 Cap蛋白为3b亚型,与河北省9株PCV3 Cap蛋白的同源性在97.8％～99.8％;所获得的PCV3与PCV1和PCV2全基因组序列的同源性均小于50％,遗传进化树分析3种PCV处于不同的分支,表明其属于不同的基因型;与国内外其他43株PCV3全基因组序列的同源性在98.7％～99.3％,其中与俄罗斯PCV3毒株(GenBank登录号:MG679916)的同源性最高,为99.3％,表明不同PCV3毒株之间的全基因组序列的同源性很高,尚未发现明显的变异;与GenBank上已发表的全部国内外174株PCV3的全基因组序列进行遗传进化树分析,发现全球PCV3及其亚型的分布有地域的差异.[结论]获得1株新PCV3毒株,其与PCV1、PCV2属于不同的基因型;不同PCV3毒株之间存在着较高的同源性;全球PCV3及其亚型的分布与地域有一定的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李杰峰		20	26	3.0	4.0
2	杨威		6	15	2.0	3.0
3	马玉忠	河北农业大学动物医学院	41	123	6.0	9.0
4	赵志强		12	16	2.0	4.0
5	段宝宁		2	0	0.0	0.0
6	王承玉	河北农业大学动物医学院	2	0	0.0	0.0