COI基因DNA条形码技术在福建省蜱类鉴定中的应用

• 作者: 刘维俊 刘菁 周淑姮 肖方震 邓艳琴 韩腾伟
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: COI基因 蜱类 DNA条形码技术 分子鉴定 系统发育 福建
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 25-31
• 页数: 7页
• 分类号: R384.4|Q969
• 字数: 4358字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2019.00.104

摘要

目的 探讨基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因的DNA条形码技术应用于福建省蜱类鉴定的可行性.方法 蜱标本经形态学鉴定后提取基因组DNA,PCR扩增COI基因片段,并进行测序和比对,用Kimura-2-parameter模型计算种内及种间遗传距离,以邻接法构建系统发育树.结果 经形态学鉴定,97只蜱隶属于5属12种,遗传距离计算结果显示,种间遗传距离(14.65％～26.79％)显著大于种内遗传距离(0～7.14％);BLAST同源性比对发现GenBank数据库中尚无越原血蜱(Haemoph ysalis Yeni)与基刺硬蜱(Ixodes spinicoxalis)的COI基因序列,褐黄血蜱(H.flava)、台岛血蜱(H.formosensis)、豪猪血蜱(H.hystricis)、粒形硬蜱(I.granulatus)、微小扇头蜱(Rhi picephalus microplus)与血红扇头蜱(R.sanguineus)的形态学鉴定与DNA条形码鉴定结果一致,但是,龟形花蜱(Amblyomma testudinarium)、台湾革蜱(Dermacen-tor taiwanensis)、中华硬蜱(I.sinensis)的形态学鉴定与COI基因DNA条形码鉴定结果不一致;系统发育树显示,同一物种的不同个体均形成高支持率的单系,种间分支很明显.结论 COI基因DNA条形码测定是一种快速准确的蜱类鉴定新兴技术,但现阶段,COI基因DNA条形码技术尚不能完全脱离传统的形态学鉴定而独立进行,两者应有机结合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖方震	福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室	20	59	5.0	6.0
2	刘维俊	福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室	4	2	1.0	1.0
3	韩腾伟	福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室	6	7	2.0	2.0
4	周淑姮	福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室	11	44	4.0	6.0
5	刘菁	福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室	5	5	1.0	2.0