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转座子引起的猪ktn1基因结构变异及其与生产性能的关联分析
转座子引起的猪ktn1基因结构变异及其与生产性能的关联分析
作者:
宋成义
王伟
王宵燕
郑尧
陈伟
陈才
顾浩
高波
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
转座子
插入多态
结构变异
ktn1基因
关联分析
摘要:
为探明转座子对猪的ktn1基因及其侧翼区结构变异的贡献,从全基因组测序(WGS)数据库中获取14个猪基因组中的ktn1基因序列和侧翼序列,通过ClustalX多序列比对和RepeatMasker转座子注释,全面解析转座子对ktn1的影响.通过PCR检测到一个SINEA1转座子插入多态,在苏姜猪群体中与相关性状进行关联分析.结果 显示,ktn1基因及其侧翼区中含有至少77个转座子片段,其中绝大部分(98.70%)为SINE类转座子,并鉴定到9个小结构变异和4个由转座子引起的大结构变异,表明转座子是基因变异的重要来源.其中一个SINEA1插入多态引起的结构变异,在不同品种中呈现丰富的多态性,且无插入个体(SINE-/-)苏姜猪的断奶窝重 ((64.20±10.6) kg)比纯合有插入个体(SINE+/+) ((74.14±9.0) kg)和杂合有插入个体(SINE+/-) ((69.71±7.7) kg)轻(P<0.05),表明基于转座子插入多态研发分子标记具有可行性,提示转座子插入多态分子标记在分子辅助育种中具有较强的应用潜力.
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内容分析
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(/年)
文献信息
篇名
转座子引起的猪ktn1基因结构变异及其与生产性能的关联分析
来源期刊
生物工程学报
学科
关键词
转座子
插入多态
结构变异
ktn1基因
关联分析
年,卷(期)
2020,(2)
所属期刊栏目
动物及兽医生物技术
研究方向
页码范围
267-275
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13345/j.cjb.190179
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
高波
扬州大学动物科学与技术学院
64
338
9.0
15.0
2
王宵燕
扬州大学动物科学与技术学院
56
258
8.0
13.0
3
王伟
扬州大学动物科学与技术学院
56
283
10.0
15.0
4
陈伟
扬州大学动物科学与技术学院
25
195
7.0
13.0
5
顾浩
扬州大学动物科学与技术学院
19
19
3.0
4.0
6
陈才
扬州大学动物科学与技术学院
8
7
2.0
2.0
7
郑尧
扬州大学动物科学与技术学院
1
0
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转座子
插入多态
结构变异
ktn1基因
关联分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物工程学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3061
CN:
11-1998/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
82-13
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
4562
总下载数(次)
20
总被引数(次)
43879
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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