猕猴桃褪绿环斑相关病毒在陕西省的分布、分子变异及其2个分离物的基因组序列

• 作者: 吴云锋 吴宽 曹孟籍 王乔春 赵磊 顾沛雯
• 来源期刊: 植物保护学报
• 关键词: 猕猴桃 猕猴桃褪绿环斑相关病毒 基因组 分子变异 陕西
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 365-371
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13802/j.cnki.zwbhxb.2020.2019108

摘要

为明确我国陕西省猕猴桃主产区的徐香、海沃德、华优和秦美4个猕猴桃品种上的猕猴桃褪绿环斑相关病毒(Actinidia chlorotic ringspot-associated virus,AcCRaV)的分布情况,对采集自该省4个地区的493份样品进行AcCRaV检测,基于cp基因序列对获得的AcCRaV分离物进行分子变异分析,并采用高通量测序技术对其中2份样品进行转录组测序.结果 显示:AcCRaV在陕西省猕猴桃上分布广泛,且检出率较高,其中周至县秦美猕猴桃上AcCRaV的检出率最高,为45.0％,在杨凌区秦美猕猴桃上AcCRaV的检出率最低,为10.0％.测定的23个AcCRaV分离物cp基因序列全长均为945 nt.系统发育树显示AcCRaV分离物共分成2个组,存在较大的分子变异.AcCRaV的cp基因分子变异与猕猴桃品种有一定关系,而与地理位置相关性不明显.获得了2个AcCRaV分离物ZZ1和ZZ2的基因组序列,RNA1长度分别为7 049 nt和7 274 nt,RNA2长度均为2 266 nt,RNA3长度分别为1 691 nt和1 696 nt,RNA4长度分别为1 736 nt和1 683 nt,RNA5长度分别为1 460 nt和1 497 nt.分离物ZZ1和ZZ2的基因组序列与GenBank中唯一报道的我国湖北省AcCRaV分离物HN-6基因组序列比对中,分离物ZZ2与HN-6的RNA4同源率最高,为96.0％,分离物ZZ2与HN-6的RNA1同源率最低,为87.8％.表明AcCRaV在我国陕西省猕猴桃主产区分布较广泛,且其分子变异与猕猴桃品种有一定关系.