90份鳄梨种质资源AFLP遗传多样性分析

• 作者: 付小猛 周东果 岳建强 李进学 杨帆 王绍华 董美超 郭莉娜 高俊燕 龙春瑞
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鳄梨 AFLP 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 13-19
• 页数: 7页
• 分类号: S667.9
• 字数: 3721字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.01.003

摘要

[目的]本研究对采自中国云南德宏、保山、西双版纳、普洱、红河和缅甸克钦邦、掸邦地区共90份鳄梨种资资源进行遗传多样性分析,为其新品种选育和种质创新提供参考依据.[方法]采用CTAB法提取鳄梨叶片基因组DNA,利用扩增片段长度多态性分子标记技术,对90份种质资源的基因组DNA进行酶切、连接、预扩增、选择性扩增,电泳分离,银染显色.电泳结果得到“0,1”矩阵,使用POPGENE32软件计算每对引物的多态性条带、多态性比率、有效等位基因数、遗传多样性指数等指标,同时使用NTSYSpc-2.11F计算种质间遗传相似系数,根据相似性系数进行UPGMA聚类分析和PCA主效应分析,对鳄梨种质资源进行分类.[结果]从24对AFLP引物组合中,筛选出8对扩增条带清晰、多态性高的引物组合,8对引物共扩增出1 165个条带,其中多态性条带有1 163个,多态位点百分率为99.83％;有效等位基因数(Ne)平均1.2944个;Nei's基因多样性指数(H)平均0.209 5;Shannon信息指数(I)平均0.353 0.根据遗传相似系数进行聚类分析,在遗传相似系数0.752处可划分为4个类群,第1类群有1份保山种质70号;第Ⅱ类群有24份种质;第Ⅲ类群有1份西双版纳种质59号;第ⅣV类群有64份种质.在遗传相似系数0.763处可将第ⅣV类群划分为3个亚群(A、B和C).用PCA法对90份鳄梨种质AFLP标记结果进行主效应分析,显示了不同种质的分类位置,主效应分析结果与分子聚类结果基本一致,呈一定的地域性分布规律.[结论]90份种质资源的遗传多样性较为丰富,59号和70号相对特殊,在种质创新中应给予重点关注.