基于高通量测序的老年人肠道菌群多样性分析

• 作者: 任艳丽 卢伟力 姚水洪 洪萌 邱惠萍 邵骏威 陈智
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 老年人 肠道菌群 高通量测序 PICRUSt功能预测
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 细菌学
• 页码范围: 262-268
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn112309-20190813-00252

摘要

目的 利用高通量测序技术,研究老年人肠道菌群多样性随年龄变化的特点.方法 招募90例健康志愿者为研究对象,按年龄进行分组,其中＜60岁(中青年组)为基线对照Age A组,年龄≥60岁者以每10岁为一个年龄段分为Age B、Age C、Age D、Age E 4组.采集研究对象粪便样本,提取DNA,采用二代高通量基因测序技术,对16S rDNA V3～V4高变区进行扩增测序、生物信息学分析,比较不同年龄老年人群肠道菌群和功能基因的差异.结果 在门水平上,不同年龄组肠道菌群组成包括厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门4个主要门,其中占比最高的是厚壁菌门,占60％以上,其次为拟杆菌门;从属水平上,粪杆菌属(Faecalibacterium)随着年龄增加丰度不断降低.α多样性分析显示,不同年龄老年人肠道菌群的丰度较高,均匀度较好,各组间无明显差异性;但是β多样性分析发现,Age A组和Age B组群落结构组成差异较大;Age B组和Age C组群落结构相似性最高.结论 从中青年过渡到60岁以上,肠道菌群的群落结构发生了变化,在60～ 80岁趋于相对稳定,年龄超过80岁其菌群结构再次发生变化,老年人慢性炎症性疾病、代谢性疾病和肿瘤多发可能与Faecalibacterium菌的降低有关.