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摘要:
目的 通过对小儿类风湿关节炎全基因组基因拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的研究,为该病易感基因筛选和发病机制研究提供理论基础.方法 选取小儿类风湿关节炎患者(Juvenile rheumatoid arthritis,JRA) 20例作为患病组,随机从体检中心选取无类风湿关节炎患病史健康儿童20例作为健康对照组.采用测序仪分别对类风湿关节炎患病组和健康组的DNA-pool进行全基因组重测序,用生物信息学软件对测序数据进行分析.结果 我们采用CNVnator软件对患病组和健康组的测序数据进行检测,发现CNV位点分别为7479个和5201个.通过生物信息学分析筛选,患病组与健康组比较发现有825个CNVs位点,其中有192个位于内含子区域,有93个位于外显子区域,1 9个位于上游位置,25个位于下游位置.结论 本研究揭示了儿童期类风湿关节炎患者的基因组拷贝数变异的变化,并发现了编码区的KIR3DL1、CD247、PPIP5K1、MI0X、ANK3、HK3基因可能为类风湿关节炎的易感基因.
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文献信息
篇名 儿童类风湿关节炎高贡献率易感基因的研究
来源期刊 中国优生与遗传杂志 学科 医学
关键词 小儿类风湿关节炎 全基因组重测序 拷贝数变异
年,卷(期) 2020,(1) 所属期刊栏目 儿童保健与遗传性疾病
研究方向 页码范围 110-112
页数 3页 分类号 R725
字数 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 文锦丽 20 87 5.0 9.0
2 邱劲军 4 6 1.0 2.0
3 李明江 1 0 0.0 0.0
4 王宇罡 1 0 0.0 0.0
5 王凯 2 0 0.0 0.0
6 贾艺聪 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
小儿类风湿关节炎
全基因组重测序
拷贝数变异
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国优生与遗传杂志
月刊
1006-9534
11-3743/R
大16开
北京市100039信箱651分箱
80-418
1981
chi
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