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摘要:
目的 探讨LINC00467调控肝细胞癌(肝癌)对索拉非尼耐药的作用机制.方法通过加权基因共表达网络分析GEO数据集GSE73571,筛选与索拉非尼耐药相关基因;并通过GO和KEGG富集分析确认与LINC00467相关的功能基因及其调控的下游基因.构建索拉非尼耐药细胞株HepG2-R,正常HepG2细胞设为HepG2-.CCK-8检测索拉非尼细胞毒性和计算IC50值;荧光定量RT-PCR检测LINC00467、周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)和细胞分裂周期蛋白45(CDC45)的mRNA表达水平.两组LINC00467、CDK1、CDC45 mRNA相对表达量比较采用t检验.结果加权基因共表达网络分析筛选与索拉非尼耐药相关基因LINC00467,GO和KEGG分析确认与LINC00467相关功能及其调控下游基因CDK1和CDC45.荧光定量RT-PCR检测发现HepG2-R细胞LINC00467 mRNA相对表达量为2.49±0.30,明显高于HepG2-P细胞的1(t=4.91,P<0.05);siRNA干扰后LINC00467 mRNA相对表达量为0.36±0.04,干扰前为1,LINC00467 mRNA表达明显降低(t=-14.60,P<0.05).转染siRNA-LINC00467可将耐药细胞对索拉非尼的IC50值从14.03μmol/L降低至7.33μmol/L.CDK1和CDC45在HepG2-R耐药细胞中表达升高,而siRNA干扰LINC00467的表达导致CDK1和CDC45在HepG2耐药细胞中的表达明显降低.结论基于公共数据库挖掘发现LINC00467在肝癌中高表达,LINC00467可能通过上调CDK1和CDC45参与调控细胞周期以及DNA损伤修复过程,从而促进肝癌对索拉非尼耐药.
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文献信息
篇名 LINC00467调控CDK1和CDC45促进肝细胞癌对索拉非尼耐药的研究
来源期刊 中华肝脏外科手术学电子杂志 学科
关键词 癌,肝细胞 索拉非尼 耐药 LINC00467 CDK1 CDC45
年,卷(期) 2020,(3) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 289-294
页数 6页 分类号
字数 4000字 语种 中文
DOI 10.3877/cma.j.issn.2095-3232.2020.03.019
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陈亚进 中山大学孙逸仙纪念医院肝胆外科 122 656 14.0 21.0
2 商昌珍 中山大学孙逸仙纪念医院肝胆外科 49 275 11.0 15.0
3 谭文亮 中山大学孙逸仙纪念医院肝胆外科 5 5 2.0 2.0
4 林治荣 中山大学孙逸仙纪念医院肝胆外科 1 0 0.0 0.0
5 覃胜海 中山大学孙逸仙纪念医院肝胆外科 1 0 0.0 0.0
6 陈新明 中山大学孙逸仙纪念医院肝胆外科 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
癌,肝细胞
索拉非尼
耐药
LINC00467
CDK1
CDC45
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华肝脏外科手术学电子杂志
双月刊
2095-3232
11-9322/R
16开
广州市天河路600号
44-113
2012
chi
出版文献量(篇)
1042
总下载数(次)
3
总被引数(次)
2925
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导