茶树CsGME1基因的克隆与逆境胁迫响应分析

• 作者: 刘婧愉 庄静 李辉 杨雅焯 林士佳 滕瑞敏
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 茶树 CsGME1 多序列比对 进化分析 非生物胁迫 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 232-239
• 页数: 8页
• 分类号: Q785|Q786
• 字数: 5303字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2020.02.0232

摘要

该研究基于茶树转录组和基因组信息,以茶树‘龙井43’为实验材料,从其cDNA中克隆获得茶树CsGME1基因,并对其蛋白序列特征、基因表达模式及其在不同非生物胁迫下的表达水平进行实时荧光定量分析.结果 显示:(1)茶树CsGME1开放阅读框长度为1 131 bp,编码376个氨基酸;该序列与多个相关物种的GME氨基酸序列一致性为94.25％,均含有NAD结合域.(2)进化树分析表明,茶树CsGME1基因与番茄SlGME1亲缘关系较近,与水稻OsGME2亲缘关系最远.(3)CsGME1蛋白属于亲水性蛋白,理论相对分子量为42 046.84 Da,理论等电点为5.73,具有4个无序化区域,无序化程度较低;CsGME1蛋白二级结构由39.25 ％ a-螺旋,13.26％延伸主链,5.84％β-转角和41.38％随机卷曲组成;三级结构分析结果显示,CsGME1包含螺旋和随机卷曲,与二级结构吻合.(4)荧光定量分析结果显示,在高温(38℃)、低温(4℃)、干旱(20％ PEG)和高盐(200 mmol·L-1NaCl)4种非生物胁迫处理下,茶树CsGME1基因均有响应,且表达存在差异,推测CsGME1参与了茶树的逆境胁迫响应过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李辉	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	38	162	7.0	12.0
2	庄静	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	21	72	5.0	8.0
3	林士佳	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	3	0	0.0	0.0
4	滕瑞敏	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	8	6	2.0	2.0
5	刘婧愉	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	2	0	0.0	0.0
6	杨雅焯	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	1	0	0.0	0.0