高通量技术检测抑癌基因Pitx2静默后 PanIN细胞中下游基因改变

• 作者: 王琪 许斌 钱雨婷
• 来源期刊: 内科理论与实践
• 学科: 医学
• 关键词: 基因表达谱 胰腺上皮内瘤变 Pitx2基因 胰腺肿瘤
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 261-267
• 页数: 7页
• 分类号: R735.9
• 字数: 4198字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16138/j.1673-6087.2020.04.011

摘要

目的:运用小鼠基因转录本的全基因表达谱芯片,研究Pitx2基因静默前后胰腺上皮内瘤变(pancreatic intraepithelial neoplasia,PanIN)细胞下游基因表达谱的变化.方法:应用小鼠全基因芯片检测Pitx2基因静默前后PanIN细胞基因表达谱的变化,并运用实时荧光定量多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)对部分芯片结果进行验证.结果:根据基因芯片筛选出差异倍数3倍以上的差异表达基因共97条.其中上调58条,涉及细胞增殖的基因包括Rac1、Ccr1、Fut9、PPP3CA、Sox5、Bmp7、Chtf18、Btg4、Flt4、Dscaml1和Pftk1;涉及细胞转移的基因包括Sesn1、Rpl7a、PPP3CA、Sox5、Bmp7、PIK3C2G、Cxcl12、Btg4和Kcnj14.下调39条,涉及细胞增殖的基因包括PPP2R2A、Nav1、PPP2R3C、Katnb1、Gpbp1、Nat3、Tgm5和PRKRA;涉及细胞转移的基因包括PPP2R2A、Lce1c、Hcn1、PPP2R3C、Tbxas1、Chrna1、Frmd5和Cdh7.其余基因涉及细胞周期、细胞死亡调控、细胞黏附、细胞转录活性、细胞转移酶活性.通过实时定量PCR对部分基因进行验证,显示基因芯片的结果与实时定量PCR验证结果基本一致.结论:通过基因芯片技术筛选出Pitx2基因静默前后PanIN细胞下游差异表达基因,为后续体内、外实验奠定了良好的基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许斌	上海交通大学医学院附属瑞金医院消化内科	17	48	3.0	6.0
2	王琪	上海交通大学医学院附属瑞金医院消化内科	30	52	4.0	6.0
3	钱雨婷	上海交通大学医学院附属瑞金医院消化内科	3	20	2.0	3.0