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酉州乌羊LncRNA XLOC_15448的组织表达及其在黑色素沉积过程中互作分子的预测
酉州乌羊LncRNA XLOC_15448的组织表达及其在黑色素沉积过程中互作分子的预测
作者:
付琳
任航行
刘良佳
周鹏
孙晓燕
张丽
李杰
王高富
蒋婧
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
酉州乌羊
长链非编码RNA(LncRNA)
组织表达
B16细胞
黑色素
摘要:
长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)在哺乳动物的基因组中被广泛转录,能够通过相应的micRNA和靶基因发挥其生物学功能,并通过生物信息学预测和实验验证相结合方法,快速、有效地获取并筛选LncRNA靶基因.为探究酉州乌羊(Capra hircus)LncRNA XLOC_15448的组织表达谱及其在黑色素沉积过程的靶基因,本研究以酉州乌羊和酉州本地白山羊为实验对象,检测LncRNA XLOC_15448在各组织中的表达,比较其在乌皮与非乌皮中的表达差异;同时,检测LncRNA XLOC_15448在小鼠(Mus musculus)皮肤黑色素瘤细胞细胞系B16-F10中的表达特性;最后,通过靶micRNA和靶基因预测,构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络关系.研究结果显示,LncRNA XLOC_15448在酉州乌羊不同体组织中广泛表达,其中在心脏中的表达量最高,其次为肌肉、大脑、皮肤、肝、肾、肺、脾脏组织;其中在酉州乌羊皮肤中的表达量显著高于酉州本地白山羊皮肤组织;体外实验研究发现,随着B16-F10细胞的增殖,LncRNA XLOC_15448表达量呈递增趋势;同时,软件预测显示,LncRNA XLOC_15448可能通过靶向miR-182-5p调控小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)基因的表达.基于此,本研究表明LncRNA XLOC_15448可能通过LncRNA-miRNA-mRNA网络参与了酉州乌羊皮肤黑色素细胞的生长及黑色素的沉积,这为进一步深入探究山羊皮肤着色相关的lncRNA调控理论的研究提供了基础资料.
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篇名
酉州乌羊LncRNA XLOC_15448的组织表达及其在黑色素沉积过程中互作分子的预测
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
酉州乌羊
长链非编码RNA(LncRNA)
组织表达
B16细胞
黑色素
年,卷(期)
2020,(8)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
1441-1449
页数
9页
分类号
S828.2
字数
6111字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2020.08.011
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长链非编码RNA(LncRNA)
组织表达
B16细胞
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研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
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农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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