2017年昆明市手足口病患儿柯萨奇病毒A组6型VP1区基因特征分析

• 作者: 李楠 伏晓庆 向以斌 寸建萍 姜黎黎 周晓芳 田炳均
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 关键词: 手足口病 柯萨奇病毒A组6型 VP1基因 昆明市
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 论著|Original Articles
• 页码范围: 350-354
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2020.0006

摘要

目的 分析2017年昆明市手足口病(hand,foot and mouth disease)患儿柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6) VP1区(915 bp)基因特征.方法 对2017年云南省手足口病实验室监测系统分离到的昆明市21株CV-A6毒株的VP1区基因进行扩增和测序,并将测得的序列与NCBI数据库中的序列进行比对,运用MEGA 5.2软件构建系统进化树,进行分子流行病学分析.结果 昆明市21株CVA6毒株之间的核苷酸和氨基酸相似性分别为92.24％～ 100.00％和96.72％～ 100.00％.与原型株Gdula(AF081297)的核苷酸和氨基酸相似性为81.53％～83,50％～和94.10％～ 96.39％.基于VP1分型,昆明市21株CV-A6毒株均为D3a亚型,并分成2个不同的进化分支,其中20株为分支1(cluster 1),1株为分支2 (cluster 2).结论 2017年昆明市引起手足口病的CV-A6毒株为D3a亚型,流行存在2个传播链,应进一步加强对昆明市CV-A6的持续监测.