海岛棉转录因子基因GbTCP27的克隆及表达特性分析

• 作者: 倪志勇 曲延英 石颖颖 蔡永生 郑凯 陈全家
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 海岛棉 TCP 转录因子 亚细胞定位 表达特性
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 页码范围: 24-33
• 页数: 10页
• 分类号: S33
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2020.02.03

摘要

为探究转录因子GbTCP27在棉花纤维发育中的作用,使用RT-PCR技术从海岛棉‘新海21号’中克隆GbTCP27,并对其进行生物信息学和表达特性分析.结果 表明,该基因有1个1 017 bp的开放阅读框,编码338个氨基酸,预测分子量约为35.37 ku,等电点为9.08,分子式为C1549H2511N439O483S11,序列中含有一个高度保守的TCP结构域;氨基酸序列对比表明,海岛棉GbTCP27基因在进化过程中是相当保守的,蛋白序列与其他植物中的TCP蛋白序列有较高的一致性;亚细胞定位结果显示,GbTCP27属于核定位基因,推测GbTCP27可能在复制和转录的过程中发挥作用;进化树分析表明,海岛棉GbTCP27基因与亚洲棉GaTCP9基因分布在同一分支上;实时荧光定量PCR表明,GbTCP27基因在开花当天的花瓣和开花当天的胚珠中表达量最高;综上所述,GbTCP27转录因子可能参与棉花纤维起始期胚珠表皮细胞的发育.