猪场环境中苍蝇携带的PRRSV NSP2及ORF5基因遗传特征差异性分析

• 作者: 冯晓慧 刘金玲 单栢强 崔月娀 张飞 沈国顺 魏澍
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 遗传变异 猪繁殖与呼吸综合征病毒 苍蝇 传播媒介 传播
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 612-618
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1700.2020.05.013

摘要

为了解猪场环境中苍蝇携带的PRRSV的遗传特征,初步评估昆虫媒介传播PRRSV的潜在风险.从已证实感染PRRSV的猪场收集苍蝇和感染猪的淋巴结,分别提取RNA后采用RT-PCR扩增PRRSV的NSP2和ORF5基因,结合DNASTAR等生物学软件将其测序后的序列与其他PRRSV代表株的NSP2和ORF5基因进行生物信息学分析.结果表明:苍蝇源PRRSV NSP2基因与该猪场猪源及其他PRRSV代表株的NSP2基因核苷酸同源性为45.9％～95.9％,氨基酸同源性为33％～92.9％;ORF5基因核苷酸的同源性为61.5％～95.2％,氨基酸的同源性为32.5％～90.9％.进一步的序列分析结果显示苍蝇源与猪场猪源以及PRRSV代表株的NSP2和ORF5基因之间存在多个氨基酸位点的替换和缺失.进化树结果表明苍蝇源和该猪场猪源PRRSV的NSP2和ORF5基因均在同一分支,属于美洲型毒株,但二者分别与PRRSV GD株和NVDC株同源关系最近.综上表明,苍蝇源和该猪场猪源以及PRRSV代表株的NSP2和ORF5基因存在不同程度的差异,这些差异是否会影响PRRSV生物学特性需要后续进一步研究.研究结果对PRRSV传播途径的研究和初步评估公共卫生安全具有重要意义.