具有Ⅲ型分泌系统的Pseudomonas moraviensis FP1761植物益生功能及其全基因组分析

• 作者: 廖开吉 罗媛 夏振远 魏海雷 曾凯芳
• 来源期刊: 植物病理学报
• 关键词: 摩拉维亚假单胞菌 生物防治 植物益生菌 全基因组分析 Ⅲ型分泌系统
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 植物病害及其防治|PLANT DISEASE AND CONTROL
• 页码范围: 748-757
• 页数: 10页
• 分类号: S4321
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000341

摘要

本研究从节瓜根际分离到一株具有防病促生功能的荧光类假单胞菌FP1761.该菌株对部分植物病原真菌和细菌具有拮抗能力,能够解钾、解有机磷和无机磷,可产生氨、蛋白酶、嗜铁素、吲哚乙酸.生物测定表明菌株FP1761可显著促进小麦生长.生理生化、平均核苷酸相似度、16S rDNA和多基因分析将FP1761鉴定为摩拉维亚假单胞菌(Pseudomonas moraviensis).菌株FP1761基因组草图全长6.12 Mb,(G+C)含量为59.9％,共编码5467个基因序列.将该菌株与种内3个代表性菌株进行泛基因组和核心基因组分析,共产生4 357个共有基因,菌株FP1761特有基因327个.利用antiSMASH对菌株次生代谢基因簇进行预测,发现其含有8个潜在的次生代谢产物基因簇.其中两个基因簇与嗜铁素pyoverdine合成相关,未见聚酮类合成基因.基因组分析发现,该菌株具有与病原性假单胞菌相似的Ⅲ型分泌系统,但丢失了效应蛋白调控因子hrpS和转运相关的hrpH和hrpK1基因.对全基因组扫描,菌株FP1761仅保留了病原性假单胞菌的保守效应蛋白AvrE和HopAA1-1.FP1761是目前已发现的唯一具有Ⅲ型分泌系统的摩拉维亚假单胞菌.本研究表明摩拉维亚假单胞菌FP1761具有潜在的植物防病促生功能,但其Ⅲ型分泌系统与植物益生互作机制有待进一步解析..