基于计算机模拟技术优化筛选核酸适配体的初探

• 作者: 刘冰 吴秋月 杨艳玲 王硕 赵耀帅 高进
• 来源期刊: 中国食品学报
• 关键词: 适配体筛选 分子模拟 突变 分子对接
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 分析与检测
• 页码范围: 204-209
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16429/j.1009-7848.2020.03.026

摘要

目的:通过分子模拟技术优化筛选5'单磷酸腺苷(AMP)的高特异性适配体,利用胶体金可视化试验验证筛选结果.方法:研究文献中已知的AMP原始适配体(S0)的结合位点,对7个关键碱基进行多轮迭代单点突变,获得新的适配体,进一步比较结合自由能,优化获得特异性高的适配体序列.结果:历经5轮筛选,优化筛选出4个特异性高的新序列(S1-S4),使用胶体金的可视化检测对最佳新序列(S4)和原始序列(S0)作比较,结果发现试验结果与模拟结果一致性良好.结论:计算机模拟技术优化筛选适配体具有省时、易制备、分子质量小、储存运输简单等多种优势,为快速获得特异性适配体提供了一个新方法、新思路.